5月5日,時空組學(xué)聯(lián)盟啟動暨首期專輯成果發(fā)布會在深圳舉行。深圳華大生命科學(xué)研究院聯(lián)合多家機(jī)構(gòu)在Cell出版社官網(wǎng)以時空組學(xué)聯(lián)盟(STOC)專題的形式發(fā)布了全球首批生命時空圖譜。據(jù)悉,這是首次從時間和空間維度上對生命發(fā)育過程中的基因和細(xì)胞變化過程進(jìn)行超高精度解析,為認(rèn)知器官結(jié)構(gòu)、生命發(fā)育、人類疾病和物種演化提供全新方向。
據(jù)了解,研究人員利用華大自主研發(fā)的時空組學(xué)技術(shù)Stereo-seq,首次繪制了小鼠、斑馬魚、果蠅、擬南芥四種模式生物胚胎發(fā)育或器官的時空圖譜。其中,利用高精度大視場Stereo-seq技術(shù)繪制的小鼠胚胎發(fā)育時空圖譜相關(guān)成果在《細(xì)胞》(Cell)期刊在線發(fā)表,斑馬魚、果蠅、擬南芥時空圖譜相關(guān)成果在《細(xì)胞》子刊《發(fā)育細(xì)胞》(Developmental Cell)在線發(fā)表。該系列研究由深圳華大生命科學(xué)研究院聯(lián)合中國科學(xué)院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院、南方科技大學(xué)、華中農(nóng)業(yè)大學(xué)等來自6個國家的32個科研團(tuán)隊共同參與完成。
科學(xué)的發(fā)展離不開工具進(jìn)步。17世紀(jì),人類通過顯微鏡第一次看到了生命的微觀結(jié)構(gòu)——細(xì)胞;20世紀(jì),DNA測序技術(shù)讓科學(xué)家第一次解析了生命大分子——DNA。如今,Stereo-seq技術(shù)不僅可以精確地了解每個細(xì)胞內(nèi)的分子表達(dá),還能定位該細(xì)胞的空間位置!都(xì)胞》論文第一作者、深圳華大生命科學(xué)研究院時空組學(xué)首席科學(xué)家陳奧表示,通過Stereo-seq技術(shù),人類首次以500納米的空間分辨率實現(xiàn)了生命全景時空圖譜的繪制。在過去,要做幾千甚至上萬次的實驗才能完成的時空圖譜;現(xiàn)在,在華大自主研發(fā)的時空芯片上,只需一次定位就能實現(xiàn)。這是生命科學(xué)工具的里程碑式突破。
“時空組學(xué)技術(shù)的出現(xiàn),實現(xiàn)了生命在時間和空間維度上細(xì)胞‘地圖’的全面繪制,讓我們可以在細(xì)胞甚至亞細(xì)胞分辨率下,觀察到正常狀態(tài)和疾病狀態(tài)下分子和細(xì)胞的分布及細(xì)胞之間的互作情況,真正實現(xiàn)了從高精度結(jié)構(gòu)的角度去理解功能,這將大大推動我們對于生命復(fù)雜性和人類疾病的全面認(rèn)知!毕盗姓撐牡墓餐ㄓ嵶髡咧弧⑸钲谌A大生命科學(xué)研究院單細(xì)胞組學(xué)首席科學(xué)家劉龍奇表示。
“得益于Stereo-seq技術(shù)的超大視野,科研人員可以在發(fā)育中的小鼠胚胎上以非常高的分辨率和測序深度進(jìn)行組織的分析和研究! 時空聯(lián)盟成員、《細(xì)胞》論文共同作者、英國劍橋大學(xué)臨床醫(yī)學(xué)院院長Patrick Maxwell教授表示,利用本研究免費(fèi)公開的數(shù)據(jù),大家可以真正地理解哺乳動物是如何發(fā)育的,組織是如何組成的等問題。這也將使我們深入了解發(fā)育的過程、正常的組織功能,以及疾病。
與會同期,時空組學(xué)聯(lián)盟(STOC)宣布成立,旨在推動時空組學(xué)技術(shù)在生命科學(xué)各個領(lǐng)域的廣泛應(yīng)用,繪制人類器官、疾病、發(fā)育、演化等時空圖譜,目前已有80多位科學(xué)家加入。
時空組學(xué)聯(lián)盟成員、中國科學(xué)院院士、中科院腦科學(xué)與智能技術(shù)卓越創(chuàng)新中心主任蒲慕明表示,過去10年、20年間出現(xiàn)的各類組學(xué)所產(chǎn)生的大量數(shù)據(jù)都缺少時空信息,而時空信息的收集、分析、建模等大量工作,需要生物學(xué)、計算機(jī)、數(shù)學(xué)、工程學(xué)等多領(lǐng)域的人才加入,需要很多單位共同參與完成。
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